в.0.12 - Данбура меняла формат.
в.0.09-в.0.11 - не помню, пофиксил какие-то баги.

Заходим в администрирование -> источники приложений. Выбираем вкладку "приложения от третьих лиц" и добавляем в этот список ppa:ubuntu-wine/ppa.
После этого устанавливаем wine через центр приложений или с помощью строки sudo apt-get install wine.
Если у вас уже был установлен wine, то вместо установки его надо будет обновить.
После этого заходим в командную строку и набираем winetricks. Получаем окно с графическим интерфейсом и выбором из распространенных программ под windows. Выберите для установки microsoft .net 3.0. (Внимание! Хоть данная программа и не проверяет лицензию, использование ее не из под лицензионной винды является нарушением авторского права, я вас предупредил). Перед установкой 3.0 он сперва установит 2.0, не удивляйтесь. Во время установки 3.0 на многих машинах так и не выдается сообщения об успешном завершении установки, остается только дождаться пока установщик перестанет плодить тонны предупреждений и выключить консоль - оно на самом деле успешно установилось.
После этого взяв версию программы для .net 3.0 и переместив ее на ваш виртуальный диск C: (/home/yourusername/.wine/dosdevices/c:/ по умолчанию), вы сможете ее запускать через wine. При запуске сперва выдается ошибка, выбираем continue и после этого поработать в этой программе все же удасться.