Сюжет разворачивается через полгода после Fate/stay night, по-прежнему в городе Фуюки. Bazett Fraga McRemitz, член ассоциации магов, просыпается на 4ый день 5ой войны за Святой Грааль с новым слугой - Avenger-ом, и с полностью отсутствующими воспоминания о том, что было раньше. Теперь им предстоит выиграть эту войну.

К игре прилагается два патча до версии 1.04(файлы dngup103p.exe dngup104.exe) Запускать по порядку, в обязательном порядке через applocale, в противном случае есть риск, что кривопропатченная игра станет просто нерабочей.

Прошло несколько десятков лет с последней мировой войны. На Дальнем Востоке существует объединение островных государств в регионе - Восточный Союз, занятое работой над проектом "Next-E". Это проект по разработке многофункционального оружия массового уничтожения следующего поколения, или сокращенно AEW, в виде нового биологического компьютера, известного как компьютер "Е-серии". Искуственно созданные гибриды человека и вооружения, они представляют собой наименьшую армию в истории.

Среди Е-серии существует два типа адаптации согласно разным философиям - Белый и Черный. Наступает время практических испытаний, с окончательным принятием Е-серии на вооружение...