500 лет назад по миру Granvallen прокатилась Великая Война Магов. Шесть Лордов-демонов, падших ангелов предавших своих покровительниц, богинь-близнецов Aplyes и Espina, напали на Granvallen и учинили много разрушений. Но со временем были все же побеждены святым королевством Valence в союзе с феями и великими драконами. После этого магия была запечатана; магические врата соединявшие парящие в воздухе континенты перестали работать, и связь между материками прервалась. Но, за последние годы, технология развилась и теперь народ Granvallen может свободно перемещаться между континентами на летательных аппаратах.

Охотник за сокровищами Ragna Valentine направляется на северо-западный континент Irrbard, чтобы выполнить заключенный контракт. Но в воздушном пространстве Irrbard его подстреливает группа неизвестных, и смерть кажется неизбежной. К счастью для него, его спасает Alwen, принцесса-вампир, которая заключает с ним пакт крови. Ragna становится ее Воином Крови и моментально излечивается от своих фатальных ран благодаря новоприобретенным способностям. Когда они снова встречаются, Alwen объясняет что ее родной замок, равно как и магические способности похищены неизвестным врагом, и запрашивает помощь Ragna чтобы вернуть утраченное.

«999» является текстовой игрой приключением, которая повествует о Джунпеи, студенте колледжа, который оказывается втянутым в смертельный заговор. Он и 9 других людей были похищены и теперь вынуждены играть в смертельной игре, а главный приз – свобода…

По прошествии девяти часов Джупей и другие похищенные утонут вместе с кораблём. Нумерология, музыкальные композиции и логические головоломки, это лишь часть из 32 препятствий стоящих на пути их свободы. Главный герой должен понять, почему всё эти девять человек оказались здесь, и главное что их ждёт дальше. 9 дверей каждого заложника имеют цифровые часы, показывающие специальный номер. Эти цифры являются ключом к разгадке 9 дверей. Джупей должны разгадать ключ, чтобы открыть следующую дверь, поднимая и осматривая предметы в различных локациях.